Rune Factory: Guardians of Azuma представляет восточную нацию Азума, землю, коренным образом измененную Небесным Коллапсом. Эта катастрофа, вызванная столкновением с огромным объектом, расколола земли, прервала течение рунной энергии и стала причиной исчезновения природных божеств. В результате край оказался опустошен, а его обитатели столкнулись с лишениями.

Геймеры отправляются в приключение в мире Rune Factory: Guardians of Azuma, узрев битву драконов и услышав внутренний глас, наделяющий умениями Танцора Земли. Данная мощь – это способ возродить Азуму, побуждая главного героя сражаться с измененными созданиями и отстраивать заново селения. Центральная задача этого RPG состоит в применении упомянутых навыков Танцора, чтобы остановить порчу, охватившую весь край. В роли Танцора Земли, персонаж применяет танец, священные реликвии и свежее вооружение, включая Лук и Талисман, для избавления от скверны окружающего мира и аграрных земель.

Игровой процесс включает в себя реконструкцию поселений, где предстоит возводить постройки, чтобы вернуть обитателей, которые после этого помогают возродить общину. Этот проект также подразумевает возвращение к жизни божеств, чтобы восполнить запасы ресурсов в мире. Тайтл дает возможность выбрать протагониста мужского или женского пола, способных заводить дружбу или развивать любовные линии с разнообразными личностями через полностью озвученные диалоги. Такие соратники впоследствии могут помочь в сражениях. Место действия характеризуется стилистикой Страны восходящего солнца в облике героев и локаций, со сменяющимися временами года и аутентичными деталями, которые видны в пейзажах и событиях.