Carrier Command 2 представляет собой современное продолжение стратегии, что выходила ещё в восьмидесятых. На фоне других тайтлов сиквел выделяется особенностями геймплея. Это не только RTS, но ещё и симулятор командира авианосца. Задача геймера: освободить расположенную на архипелаге колонию Телос от захвативших её террористов.

В Carrier Command 2 пользователь руководит огромным военном кораблем. Он способен уничтожать противников с помощью торпед, пушек, турелей и ракет. На его палубе позволяют размещать наземных и воздушных юнитов (всего их по 8 разновидностей каждого типа). Тут позволяют конструировать военные машины из модулей. Можно выбирать шасси, вооружение, дополнительное снаряжение и т. п. В этом проекте надо захватывать острова, чтобы получать снабжение для армии. Управление техникой происходит непривычным для жанра способом. Здесь нельзя выделять рамкой боевые единицы и направлять их с помощью мыши.

Пользователь сидит в капитанской рубке и раздает оттуда приказы. Игрок бегает между боевыми постами, нажимает кнопки на панелях, получает информацию о поле боя с радаров и других устройств. Тут нужно вручную переключать режимы карты, включать и выключать двигатели основного транспорта, набирать и сбрасывать скорость, крутить штурвал, осматривать место битвы с помощью беспилотника или перископа и так далее. В игре есть обучение, сюжетная кампания, отдельные зарубы с ботами и кучей настроек, мультиплеер с поддержкой до 16 участников. В онлайне присутствует кооператив и PvP.