Way of the Samurai 3 – это цифровое воплощение бусидо, сурового кодекса самурая. Игроку предстоит прожить десять дней в роли японского воина, чудом уцелевшего после жестокой битвы. Тяжелораненого бойца находят местные крестьяне и предлагают помощь. Реакция главного героя полностью зависит от выбора игрока. Можно обнажить катану, чтобы напугать или даже убить спасителей, а можно с благодарностью принять их предложение, остаться в деревне, залечить раны и обрести душевное равновесие.

В распоряжении игрока чуть больше недели игрового времени, чтобы изучить окрестности, познакомиться с персонажами, помогать жителям или вступить на службу к местному правителю. Сутки в этой игре длятся 24 реальные минуты, и то, как распорядиться этим временем, каждый решает сам. По истечении срока будут подведены итоги: скольких врагов одолел самурай, кого обманул или обидел, кому оказал поддержку. На основе поступков персонажа в Way of the Samurai 3 начисляются очки, отражающие уровень его чести и благородства. Чем выше итоговый балл, тем лучше.

Каждый новый день главный герой может спланировать совершенно по-разному. Можно вступиться за крестьян, защищая их от разбойников, или завести светскую беседу с дамой на мосту. Есть возможность отправиться в храм для совершенствования боевых искусств или заказать кузнецу уникальный клинок. Однако стоит помнить: чем больше неоправданных убийств, тем ниже будет рейтинг в этой игре, ведь согласно бусидо, жизнь человека бесценна, и самурай должен чтить ее как величайшее благо.