Click and Conquer — это игра, где вы управляете ресурсами через военные операции. Основной игровой процесс строится вокруг сброса бомб на поле, чтобы находить скрытые вражеские юниты. Каждый обнаруженный отряд приносит валюту, которая служит главным ресурсом для вашего развития. Заработанные средства можно вложить в увеличение пассивного дохода или в усиление мощности каждого взрыва. Цикл трат и накоплений определяет, как быстро вы будете продвигаться по этапам игры.

Главная цель в игре Click and Conquer — пройти все 12 карт. Каждая новая локация предлагает большую территорию для зачистки и обещает более высокие награды. Развитие персонажа разделено на две отдельные ветки улучшений: одна отвечает за экономику, а другая — за боевую эффективность. Умное распределение ресурсов между этими направлениями — ключ к покорению всех доступных земель.

Эта игра также включает систему престижа, которая позволяет полностью сбросить текущий прогресс. Такой шаг обменивает ваши пройденные карты и купленные апгрейды на постоянные бонусы, сохраняющиеся при всех последующих перезапусках. Один из таких уникальных бонусов — ядерная бомба, меняющая стандартный подход к зачистке игрового поля. Эти перманентные усиления добавляют новый, долгосрочный уровень развития, выходящий за рамки обычных веток прокачки.