В игре Death end re;Quest органично переплетаются два игровых жанра, создавая уникальный дуэт внутри одного проекта. Их сюжетные линии тесно связаны, но каждая предлагает свой, особый геймплейный опыт. Сюжет игры вращается вокруг студии, создающей MMORPG для виртуальной реальности. Одна часть истории разворачивается в реальном мире, а другая — внутри самой игры.

В реальности игрок погружается в режим визуальной новеллы, управляя программистом Аратой. Он трудится в компании, некогда начавшей разработку инновационной онлайн-RPG World’s Odyssey, но позже забросившей проект из-за внутренних неурядиц и критических ошибок. Более того, год назад бесследно исчезла одна из создательниц игры, Шина. Однако однажды вечером главный герой обнаруживает, что серверы игры всё ещё активны, а его пропавшая коллега оказалась единственным игроком в этой сети.

Вторая часть игры Death end re;Quest построена на классической механике jRPG. Здесь вы берёте под контроль Шину, которой предстоит найти путь к спасению из виртуальной ловушки. Единственная возможность — пройти World’s Odyssey до «истинной» концовки, шанс на которую составляет лишь 1%. Этот режим включает в себя развитие персонажей, пошаговые сражения с оригинальными механиками, битвы с грозными боссами и другие узнаваемые черты японских ролевых игр. Однако без помощи Араты из внешнего мира ей не обойтись. Постоянное переключение между двумя мирами и жанрами — ключевая особенность игры Death end re;Quest, которая обеспечивает разнообразие и не даёт игровому процессу стать однообразным.