Hunted Within: The Walls помещает потерявшего память протагониста в гигантский лабиринт. Главная задача — исследовать мрачные и непохожие друг на друга локации, от густых лесов до тёмных пещер, для раскрытия тайны своего заточения. Выживание напрямую зависит от умения ориентироваться во враждебных зонах и искать путь к спасению. Каждый новый сектор бросает уникальный вызов, заставляя приспосабливаться к опасностям, таящимся в его массивных стенах. Ключевой конфликт строится на противостоянии окружению и его неведомым обитателям.

Смена дня и ночи определяет основные занятия в Hunted Within: The Walls. Светлое время суток отводится на сбор ресурсов и поиск чертежей, необходимых для создания оружия, инструментов и прочего снаряжения. С наступлением темноты лабиринт становится куда опаснее: на охоту за игроком выходят неведомые твари. Такая смена обстановки заставляет стратегически переходить от исследования к обороне, совмещая прямые столкновения и скрытные действия для преодоления ночных угроз. Цикл из дневной подготовки и ночного выживания — основа всего геймплея.

Для продвижения по сюжету необходимо находить редкие Камни-Артефакты, служащие ключами к главной тайне. По ходу повествования противники становятся всё более грозными: от бесшумных преследователей до иных чудовищ, затаившихся в глубинах этого места. Чтобы противостоять растущей угрозе, созданное вооружение можно модифицировать для повышения его эффективности в бою. Конечная цель геймера — выяснить, кто стоит за этим испытанием, и наконец покинуть стены, завершив историю.