Kyoto Anomaly погружает игрока в запутанную, закольцованную сеть киотских улочек. Главная задача в этой игре — пройти по этому городскому лабиринту и добраться до храма Хокан-дзи раньше, чем его заполонят туристы, однако цель постоянно ускользает. Движение вперед зависит от тщательного осмотра окружения в поисках мельчайших аномалий, после чего необходимо сделать ключевой выбор. Неверный поворот или пропущенная странность ведут в бесконечную ловушку, заставляя вновь и вновь начинать путь в циклически повторяющихся локациях.

Сюжет Kyoto Anomaly начинается с попытки героя посетить храм Хокан-дзи, но все усилия не приближают его к цели. Вскоре становится ясно, что он заперт в бесконечно повторяющихся отрезках улиц, что создает нарастающее чувство тревоги. Вырваться из этого круга можно, лишь обнаружив специфические странности или предметы, находящиеся не на своем месте, — они и служат отличительными признаками каждого нового цикла. На прохождение этой игры уходит от 30 до 90 минут, в зависимости от того, как быстро игрок распутает ее загадку.

Перемещение требует предельной внимательности к деталям. Заметив аномалию, нужно свернуть налево; если же все выглядит обыденно — направо. Такая система принятия решений на каждом перекрестке определяет судьбу персонажа и ведет к одному из пяти возможных финалов. Более 32 уникальных вариаций окружения проверяют вашу наблюдательность. Проект предлагает озвучку на японском и английском языках, а среди повторяющихся декораций можно найти небольшую отдушину — например, погладить кошку.