Trinity Fusion – это научно-фантастический рогалик в формате 2,5D с видом сбоку, элементами платформера и экшена. Игра предлагает процедурно генерируемые локации, которые собираются из множества заранее подготовленных комнат – всего доступно около сотни их вариаций. Помимо основных забегов, здесь есть арена для сражений и отдельные испытания. Геймплей включает бег, прыжки, ближний и дальний бой, разрушение препятствий, увороты от атак и комбинации ударов в воздухе. Противниками выступают роботы, мутанты и различные гуманоиды. Действие игры разворачивается в мультивселенной, где героине предстоит спасать гибнущие миры. События происходят одновременно в трёх измерениях с уникальными биомами и индивидуальным прогрессом, между которыми можно свободно переключаться. По ходу прохождения открываются новые точки старта и постоянные улучшения. В каждой реальности у протагонистки своя личность, и все они существенно отличаются друг от друга.

В итоге, в Trinity Fusion представлены три разные героини:

• Альтара – обладательница голубых волос, мастер гаджетов, способная к телепортации и управлению дронами;
• Кера – зеленоволосая воительница с крюком-кошкой, виртуозно владеющая оружием ближнего боя, от мечей до огромных молотов;
• Найра – девушка-рейнджер, специалист по дальнему бою, использующая бластеры, винтовки, футуристические луки и другое стрелковое вооружение.