Chosen War предлагает игроку примерить роль Избранного, чья миссия — собрать армию и повести ее в бой по всему архипелагу. Вам предстоит исследовать окутанные туманом земли, сражаться с врагами и тактически размещать свои отряды на поле боя. Игра строится вокруг исследования мира и управления запасами провизии. Финальная цель каждой кампании — противостояние с Верховным Жрецом в специальной локации. Процедурная генерация гарантирует, что маршруты, расположение врагов и события будут уникальными для каждого нового похода.

В игре Chosen War победы в сражениях приносят дары от божества по имени Бог Спагетти. Эти награды включают улучшения для ваших отрядов, а получение третьего апгрейда для определенного типа юнитов кардинально меняет их способности. Игроки могут тратить золотые монеты, чтобы получить новый набор усилений. Эта же валюта играет ключевую роль при встрече с Хитрым Торговцем. На специальных торговых точках он предлагает предметы, новых рекрутов и навыки для изучения в обмен на золото.

Геймплей этой игры предоставляет множество стратегических возможностей помимо прямых столкновений. Например, на Алтаре Чудес можно воскресить павших воинов, но они вернутся в строй ослабленными. Также можно штурмовать тюрьмы, охраняемые местными обитателями, чтобы освободить пленников и пополнить ими свою армию. Перемещение между островами осуществляется на лодке, что расходует припасы, или с помощью телепортации между особыми сахарно-треугольными островами, которая не требует затрат провизии. Некоторые территории скрывают сокровища под защитой гарнизонов, и чтобы завладеть добычей, вам придется одолеть эти отряды.