Повествование Keeper начинается с пробуждения давно спящего маяка на острове. Движимое неведомой целью и сопровождаемое морской птицей, строение отправляется в одиссею по окрестностям. Этот поход направляет дуэт к центру острова и в неизведанные области. Это приключение-головоломка от третьего лица рассказывает историю без единого слова, передавая сюжет при помощи кинематографичных и атмосферных элементов. События разворачиваются на уединенном острове в затерянном море, у подножия далекой горной вершины.

Геймплей Keeper сосредоточен на исследовании мира и решении головоломок в сюрреалистическом окружении. Игроки ведут маяк и его пернатого компаньона через череду испытаний. Продвижение по сюжету отмечено серией таинственных трансформаций, затрагивающих главного героя. Задача — проникнуть вглубь острова, навигируя по линейному пути в стилизованном фэнтезийном мире. Эта игра представляет собой одиночное приключение, сфокусированное на своей истории и тайне, побуждающей центральных персонажей двигаться от одной локации к другой.

Ключевая механика игрового процесса строится на партнерстве между подвижным маяком и морской птицей. Их совместные усилия необходимы для преодоления преград, созданных естественными и сюрреалистичными элементами окружения. По мере их движения вперед, увядающие побеги заметно разрастаются и сплетаются вокруг них. Это философский поход, экспедиция, ведущая двух героев через странные территории. Конечным пунктом назначения становится место за гранью обычного понимания, завершающее одиссею метаморфоз.