Only Up 3 повествует о герое по имени Джеки. Преодолев трущобы, он оказывается на космическом корабле, направляющемся к загадочному острову Грекко. Очутившись на новой планете, Джеки без промедления начинает новое восхождение к небу. Так формируется основа для вертикального платформера в необычном сеттинге. Суть геймплея этой игры заключается в постоянном движении вверх через разнообразные локации.

Игрок проводит Джеки через череду уникальных мест в процессе подъема в Only Up 3. Путь пролегает через заброшенные поселения, здания с паранормальной активностью, безжизненные пустыни и даже пиратские корабли, парящие на огромной высоте. По мере продвижения открываются военные базы и ожившие египетские пирамиды — все это ступени на пути к вершине острова, где, возможно, хранится разгадка предназначения героя. Базовые действия включают бег, лазание по объектам и прыжки с платформы на платформу.

Механики проекта активно используют элементы окружения, такие как ускорители, расставленные вдоль маршрута. Они действуют подобно батутам или открывают порталы для мгновенного перемещения. У Джеки также есть персональный ускоритель, позволяющий совершать двойной прыжок для преодоления больших провалов. Дизайн этой игры намеренно лишен чекпоинтов и системы сохранений, поэтому любое падение отбрасывает игрока далеко назад. Достижение наивысшей точки карты является главной целью и условием финала тайтла.