The Anomaly Experiment — это игра, в которой вы оказываетесь в роли заключенного, осужденного на пожизненный срок. Вам предлагают сделку: стать добровольцем в испытании нового препарата для лечения потери памяти в обмен на смягчение приговора. Основная механика игры заключается в том, чтобы войти в комнату, запомнить обстановку, выйти, а затем, вернувшись, отметить все обнаруженные изменения через компьютерный терминал.

Успешное выполнение этих заданий на внимательность во всех локациях — это ваш путь к свободе. Прохождение The Anomaly Experiment включает в себя исследование трех различных помещений, каждое со своей уникальной обстановкой и аномалиями, которые нужно найти. Завершение этапа в одной зоне открывает доступ к следующей. По мере вашего продвижения в игре, окружение может начать демонстрировать все более странные явления, выходящие за рамки простого изменения предметов.

Геймплей этой игры также включает опасности, требующие от персонажа конкретных действий; неверные решения приводят к гибели внутри симуляции. Ошибки во время фазы наблюдения или неправильная реакция на угрозы сокращают количество доступных попыток для героя. Потеря всех попыток приводит к смерти и необходимости перезапустить текущий раздел с самого начала. Успешное завершение уровня навсегда его открывает, сохраняя ваш прогресс и избавляя от необходимости повторно проходить уже завершенные части игры.